La mer Baltique est dans un état alarmant et est l’une des zones marines les plus menacées au monde. Les principales causes de menaces sont l’eutrophisation, la surpêche, la pollution, le bruit sous-marin et l’avancée de la crise climatique.

Les effets sont particulièrement graves dans le cas des marsouins de la Baltique. L’une des principales causes de mortalité reste la pêche au filet maillant. Les filets fins sont à peine visibles sous l'eau, les animaux se font prendre et finissent par se noyer. Des marsouins morts sont régulièrement retrouvés sur les côtes, où l'on peut détecter des blessures causées par la pêche.